غربالگری کتابخانه نمایش فاژی برای شناسایی لیگاندهای پپتیدی متصل شونده به سلول‏های سرطانی روده انسان

هدف: در سال‏های اخیر توجه ویژه‏ای به کتابخانه‏های نمایش فاژی به‏عنوان ابزارهایی برای شناسایی و جداسازی مولکول‏های دارویی (با خواص تشخیصی و درمانی) شده‏است. کتابخانه‏های پپتیدی یکی از مهم‏ترین و پرکاربردترین انواع کتابخانه‏های نمایش فاژی هستند. هدف از انجام پژوهش حاضر غربالگری کتابخانه نمایش فاژی پپتیدی ph.d.tm-7 از طریق فرآیند بیوپنینگ برای شناسایی لیگاندهای پپتیدی متصل شونده به سلول‏های sw480 (آدنوکارسینومای روده انسانی) بود. مواد و روش‏ها: سه دور بیوپنینگ روی سلول sw480 به‏عنوان سلول هدف و سلول‏های فیبروبلاست نرمال انسانی، آدنوکارسینومای معده انسانی، کارسینومای سلول‏های سنگفرشی مری انسانی و کارسینومای کبد انسانی به‏عنوان سلول‏های شاهد انجام شد. سپس با انجام plaque-pcr روی پلاک‏های به‏دست آمده از دور آخر بیوپنینگ قسمتی از ژنوم فاژهای متصل شونده به سلول sw480 که کد کننده پپتید نمایش یافته است، تکثیر و در گام بعد dna تکثیرشده تعیین توالی شد. از نرم‏افزارهای بیوانفورماتیکی برای شناسایی توالی پپتیدهای متصل شونده به سلول هدف و نیز بررسی برخی ویژگی‏های توالی‏های مزبور استفاده شد. نتایج: بیوپنینگ کتابخانه فاژی منجر به غنی‏سازی تعدادی پپتید شد که از بین آن‏ها توالی پپتیدی hamraqp دارای بیشترین فراوانی بود. بررسی بیوانفورماتیکی توالی‏های به‏دست آمده نشان داد که هیچ یک از آن‏ها جزء توالی‏های غیرمرتبط با هدف نیستند. نتیجه‏گیری: از پپتیدهای شناسایی شده، به ویژه توالی‏های پپتیدی با فراوانی بالا، به علت برخورداری از قابلیت اتصال اختصاصی به سلول sw480 می‏توان برای هدایت هدفمند ژن و دارو به سلول‏های بدخیم روده استفاده نمود.